秀姑峦溪发源于台湾岛花莲县卓溪乡境内中央山脉的秀姑峦山，源头海拔3200米，从上游沿花东纵谷往北流经卓溪、富里、玉里、瑞穗，再横断海岸山脉向东于大港口入海。秀姑峦溪全长90公里，流域面积1790平方公里，平均坡度为1:34。秀姑峦溪是台湾东部第一大河川，也是形成花东纵谷冲积扇的主要河流。主要支流有富源溪，红叶溪，丰坪溪，卓溪，乐乐溪。秀姑峦溪下游河口建有台湾第一座拱式单孔长桥，犹如长虹横卧、汹涌的溪水奔流而过，取名“长虹桥”。秀姑峦溪下游瑞穗到大港口段，长约24公里，因其河道切穿海岸山脉形成嶝谷，曲流与河阶地形十分发达：其中瑞穗至奇美路段，河道切过层状沉积岩，形成弓形的崖岸，缓陡分明，景观独特；奇美至大港口段，河道切穿硬质的火成岩，发育成曲流深谷，岩壁陡峻，河水湍急；长虹桥段的河道则巨石散布，经多年的溪大冲蚀，造成各种洁白如玉的奇岩怪石，故名“秀姑漱玉”。